Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTA1P68133 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms