Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VBP1P61758 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VBP1P61758 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VBP1P61758 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VBP1P61758 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms