Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ERVFRD-1P60508 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms