Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB25P57735 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB25P57735 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB25P57735 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB25P57735 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms