Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms