Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMTNP53814 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMTNP53814 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMTNP53814 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMTNP53814 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMTNP53814 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMTNP53814 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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