Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBX1P52954 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LBX1P52954 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBX1P52954 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBX1P52954 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBX1P52954 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms