Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRCA2P51587 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRCA2P51587 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms