Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC9A3P48764 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms