Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC4A3P48751 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms