Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZEB1P37275 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZEB1P37275 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms