Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2IP36954 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2IP36954 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms