Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TGFBR1P36897 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms