Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP1P29466 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP1P29466 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP1P29466 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP1P29466 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms