Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMBRP28336 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMBRP28336 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMBRP28336 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMBRP28336 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMBRP28336 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMBRP28336 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMBRP28336 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMBRP28336 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NMBRP28336 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NMBRP28336 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NMBRP28336 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMBRP28336 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMBRP28336 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms