Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHATP28329 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHATP28329 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHATP28329 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHATP28329 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHATP28329 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHATP28329 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHATP28329 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHATP28329 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHATP28329 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHATP28329 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHATP28329 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHATP28329 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHATP28329 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHATP28329 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CHATP28329 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHATP28329 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms