Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TNFSF4P23510 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms