Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPREP23469 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPREP23469 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPREP23469 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPREP23469 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPREP23469 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPREP23469 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms