Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
S100A1P23297 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
S100A1P23297 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
S100A1P23297 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
S100A1P23297 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
S100A1P23297 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
S100A1P23297 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
S100A1P23297 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms