Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT1P21579 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT1P21579 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT1P21579 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT1P21579 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT1P21579 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT1P21579 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT1P21579 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms