Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD247P20963 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD247P20963 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD247P20963 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms