Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACADSP16219 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACADSP16219 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACADSP16219 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACADSP16219 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms