Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TOP2AP11388 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms