Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms