Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSN3P07498 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSN3P07498 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSN3P07498 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CSN3P07498 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSN3P07498 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSN3P07498 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSN3P07498 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSN3P07498 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSN3P07498 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSN3P07498 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSN3P07498 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSN3P07498 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSN3P07498 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CSN3P07498 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms