Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTMAP06454 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTMAP06454 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTMAP06454 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTMAP06454 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTMAP06454 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTMAP06454 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTMAP06454 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTMAP06454 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTMAP06454 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTMAP06454 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTMAP06454 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTMAP06454 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms