Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYBBP04839 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYBBP04839 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CYBBP04839 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYBBP04839 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYBBP04839 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYBBP04839 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYBBP04839 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYBBP04839 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CYBBP04839 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYBBP04839 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYBBP04839 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYBBP04839 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYBBP04839 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYBBP04839 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYBBP04839 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYBBP04839 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYBBP04839 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYBBP04839 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYBBP04839 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYBBP04839 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms