Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIPRLO75663 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms