Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRMUO75648 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRMUO75648 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRMUO75648 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRMUO75648 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms