Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAMP4O75379 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms