Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRP5O75197 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRP5O75197 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRP5O75197 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRP5O75197 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP5O75197 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP5O75197 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP5O75197 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP5O75197 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP5O75197 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP5O75197 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP5O75197 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRP5O75197 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRP5O75197 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRP5O75197 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRP5O75197 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms