Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIA3O75145 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms