Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms