Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR3O43761 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms