Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN8O00124 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms