Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF879B4DU55 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms