Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POTEMA6NI47 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POTEMA6NI47 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms