Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXA2O43364 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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HOXA2O43364 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXA2O43364 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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