Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SGK3-202ENST00000396596 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SEZ6L-205ENST00000403121 3078 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF816-206ENST00000444460 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDH11Y-207ENST00000622698 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 EDAR-203ENST00000409271 4323 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SERINC3-202ENST00000342374 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL512383.1-201ENST00000624175 2677 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DLG3-210ENST00000542398 4529 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HBS1L-204ENST00000367826 2703 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNA1E-203ENST00000360108 6970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXO10-202ENST00000432825 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MLH1-201ENST00000231790 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRA2-201ENST00000356504 2770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CSF3R-202ENST00000361632 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPN20-201ENST00000374218 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NAALAD2-210ENST00000534061 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ITSN1-201ENST00000379960 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CORIN-207ENST00000505909 3018 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PPFIBP2-224ENST00000533792 3003 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 KDM5D-202ENST00000382806 5134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TIFAB-201ENST00000537858 5923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC8A1-203ENST00000403092 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRE1-205ENST00000450315 2567 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.8 ms