Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RASSF4-201ENST00000340258 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT2-201ENST00000360051 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC29A3-201ENST00000373189 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NXF5-207ENST00000537026 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL050303.4-201ENST00000624520 1839 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF691-205ENST00000372507 1683 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PNPT1-205ENST00000447944 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC45A4-201ENST00000024061 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079594.2-201ENST00000483754 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NOD1-201ENST00000222823 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RMI1-201ENST00000325875 3420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02009-201ENST00000635852 2951 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ15-207ENST00000398934 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPOR1-202ENST00000379312 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TATDN2P2-201ENST00000403590 2226 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 USF1-201ENST00000368019 998 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A4-203ENST00000368715 573 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TPTE2P5-201ENST00000379515 450 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV2-11-201ENST00000390314 400 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.5 ms