Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRELID3BQ9Y3B1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms