Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2J1Q9Y385 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms