Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHOC2Q9UQ13 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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