Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNL1Q9UK58 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNL1Q9UK58 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms