Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVK13-1Q9NX77 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms