Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD1Q9NUN5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms