Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNTG1Q9NSN8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms