Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms