Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C8orf4Q9NR00 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C8orf4Q9NR00 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms