Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM10Q9NQV6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms